1987-90 : ingénieur général de 1ère classe de l'armement au ministère de la défense.

1990-93 : chef de bureau à Bercy puis conseiller de Jean Arthuis au sein du gouvernement Juppé.

1993-97 : conseiller technique en charge de l'emploi et des affaires sociales auprès du Ministère de l'Economie et des Finances et le ministère du Budget.

1997-2001 : directeur du Fonds de Solidarité Vieillesse (FSV).

2001-03 : directeur à l’audit du groupe  AXA.

2003-04 : directeur de l'Agence Centrale des Organismes de Sécurité Sociale (Acoss).

2004 : directeur de cabinet de Philippe Douste-Blazy, ministre de la santé et de la protection sociale.

2004-14 : directeur général de la Caisse Nationale d'Assurance-Maladie des Travailleurs Salariés (CNAMTS) et directeur de l'Union Nationale des Caisses d'Assurance Maladie (UNCAM). 

Depuis 2014 : directeur général de MSH International, filiale du groupe de courtage Siaci Saint Honoré.

Frédéric Van Roekeghem se voit confier la direction générale de MSH International en 2014.

 

Après avoir exercé la fonction de conseiller technique en charge de l'emploi et des affaires sociales, il devient directeur de cabinet du ministre de la santé Philippe Douste-Blazy. A ce titre, il participe à l'élaboration de la loi de réforme de la sécurité sociale du 12 août 2004 et les accords en chirurgie privée et publics avec l'introduction de la "part variable" dans le modèle hospitalier.

 

Par ailleurs, il accompagne le lancement de la loi de réforme de l’assurance maladie qui a mis en place l’Union Nationale des Caisses d’Assurance-Maladie (Uncam).

 

Frédéric Van Roekeghem est reconnu pour avoir signé aussi deux conventions médicales : La première le 12 janvier 2005, qui portait sur la Classification Commune des Actes Médicaux (CCAM) et la deuxième, en 2006, qui concernait le corps des médecins conseil, comportant une rémunération aux résultats, ainsi que le contrat d'amélioration des pratiques individuelles.